Родился 6 июня 1937 года, городок Кракес, Кедайняйский район, Каунасский уезд, Литва.

Советский режиссер, актер, театральный деятель.

В 1955—1957 учился на актерском отделении Вильнюсской консерватории. В 1962 окончил режиссерский факультет ГИТИСа, в 1967 — Высшие режиссерские курсы при киностудии «Ленфильм».

До учебы во ВГИКе — режиссер Каунасского и Вильнюсского драмтеатров. В 1962-1963 - режиссёр Читинского драматического театра, в 1963-1964 — главный режиссер Хабаровского ТЮЗа. С 1964 работал ассистентом режиссера на Литовской киностудии.

После окончания режиссёрских курсов, в 1967-1983 - режиссёр киностудии «Ленфильм», работал с известными режиссёрами Г.Козинцевым и В.Фетиным. В 1983 году вернулся в Литву и некоторое время работал на Литовской киностудии.
В 2004 году режиссёр А.Стонис снял фильм о жизни А.Балтрушайтиса "Тот, которого нет".

Ушёл из жизни 20 августа 2015 года в Утяне. Похоронен на кладбище Расу в Вильнюсе.